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STR有何優勢?中山盛澤親子鑒定中心分享

時間:2023-11-18 10:52 閱讀:3158 來源:互聯網

STR即短串聯進行重復時間序列(shorttandemrepeat),也稱微衛星DNAmicrosatelliteDNA),是以2~6個堿基可以作為核心工作單位,重復使用串聯起來形成的一類DNA序列。整個社會人類通過基因組中平均每15kb就存在這樣一個STR,目前已發現超過7000個。由于STR核心技術單位需要重復數目在個體間呈現一種高度發展差異性且數量不斷豐富,構成了其遺傳基因多態性。

STR有何優勢?

STR位點除了具有高度的多態性外,還具有突變率低、分辨能力強、檢測標準化容易等優點,目前國際上常用的犯罪DNA數據庫大多以STR位點為基礎。

STR檢測

目前,熒光標記PCR-CE技術廣泛應用于法醫實踐,也是STR分型技術的金標準。PCR-CE技術分辨率極高,即使核心序列相差一個重復,也能成功分型。檢測結果分型譜直觀,易于分析。

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然而,PCR-CE分析存在一些不可避免的問題:

1.PCR-CE技術只能分析基因序列長度的多態性,不能區分序列中堿基的差異

2.對于混合檢材分析,不同數據來源檢材含量的比例情況相差較大懸殊時,PCR-CE往往通過檢測不到混合物中量少的檢材;

3.在對Atlas的分析中,我們經常遇到一些影響分類甚至導致錯誤分類的情況,例如,錯誤命名的等位基因標記,錯誤識別的內部標記,基線的跳躍和擺動,結巴峰,階梯下峰等。

NGS技術的誕生解決了PCR-CESTR檢測中的上述問題:

1.NGSSTR分析中更為精確,它能夠準確地檢測到DNA序列,并能夠顯示STR等位基因的核心序列和側翼序列之間的真正差異。通過NGS測序,PCR-CE分析發現同一基因型的STR位點實際上是不同的基因型。這也表明,如果達到相同的分辨率,NGS需要更少的基因座;

2.對于混合檢測中的痕量樣品,NGS憑借其高通量的特點,通過對大量數據的處理和分析,可以靈敏地檢測出痕量樣品的DNA序列;

3.基于自己一份微量檢材的一次進行實驗,NGS在獲得STR的同時,還可以通過獲得SNPIndelmRNA等各種不同類型的大量使用遺傳標記數據信息,而這是我國現有一代測序技術平臺所無法真正做到的。從微量的生物檢材中挖掘出案件所需要的全部遺傳學相關信息,這對于我們實戰來說就是具有無可比擬的吸引力。


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